Le Calcul à l'INRA : Spécificités et besoins : quelques exemples de programmes scientifiques adossés au calcul

Intervenants :

• Franck Samson (IR MIG, Jouy-en-Josas) pour Migale
• Alain Franc (DR, SFR BIE, Bordeaux-Aquitaine) pour Barcoding
• Hervé Richard pour Record (IE, MIA/BioSP, PACA)

Date : Vendredi 6 septembre 11h45-12h30

Salle : MA2

Décrire par des exemples concrets et représentatifs les principaux enjeux “computationels” de questions scientifiques traitées à l'Inra essentiellement dans les domaines de la bioInformatique et la modélisation des eco-agro-systèmes afin de permettre à un ingénieur informaticien hors institut de comprendre les missions de leurs homologues Inra et de percevoir les orientations stratégiques dans le domaine de l'informatique et du calcul.

3 exposés construits sur un plan similaire :

• Origine du projet : la question scientifique, son enjeu et les verrous techniques identifiés
• la solution déployée
• bilan et perspectives

Les sujets sont les suivant :

• Migale, sa panoplie d'outils d'analyse de génome: une PlateForme dédiée à la bioinformatique (Franck Samson)
• Un exemple de calcul pour la biodiversité : Barcoding sur la grille (Alain Franc)
• Record, la PF dédiée à la modélisation des agro-systemes et à l'interopérabilité des modèles (H. Richard)
• Conclusion : ébauches des prochaines orientations de l'institut pour le calcul (Hervé Richard).

• h_richard_record_jdev2013_t7.pdf
• f_samson_migale_jdev2013_t7.pdf
• a_franc_metabarcoding_jdev2013_t7.pdf