Un service de calcul user-friendly - illustration avec Galaxy
Galaxy est une plate-forme web ouverte qui a pour objectif de permettre à la communauté scientifique sans compétence en programmation informatique de lancer des outils (bio)informatiques sur des cluster de calcul de haute performance via une interface web. La plateforme permet de réaliser des analyses reproductibles et transparentes. Galaxy peut servir à interfacer un grand nombre d’outils à partir du moment où ils peuvent être lancés en ligne de commande sur un serveur linux. Le projet fournit à la communauté scientifique un entrepôt d’outils disponibles à l’installation appelé le Tool Shed.
Il existe plusieurs instances publiques de Galaxy à travers le monde. Cependant, Galaxy étant un projet open source, il est possible à ceux qui le souhaitent d’installer une instance locale de la plateforme afin de personnaliser son contenu en outils et la configuration matérielle sur laquelle la plateforme s’appuie.
Références :
