Journée Cogiter 2018

• Thème: instrumentation EEG/MEG/intra
• Lieu:
  Amphithéâtre
  Institut des Sciences Cognitives - Marc Jeannerod
  67 boulevard Pinel
  69500 Bron
• Date : Le 6 novembre 2018

Les sciences cognitives utilisent depuis des décennies la technique de l'EEG pour étudier le décours temporel de l'activité électrique cérébrale. C'est toutefois un examen qui requiert des conditions d'acquisition maîtrisées afin de limiter les sources de bruit et de permettre des analyses toujours plus élaborées.

Pour quels usages l'EEG est-il utile aux sciences cognitives aujourd'hui ? Pour quels usages préférer la MEG ?

Peut-on utiliser les mêmes techniques d'analyse pour des signaux EEG, MEG ou intra ?

Quels sont les différents types d'appareils disponibles aujourd'hui ?

Quels sont les retours sur les nouveaux EEG ultra-portables, dédiés au jeu ?

Comment réaliser un EEG chez le bébé ?

Comment synchroniser les signaux EEG avec les informations sur l'environnement, le reste du setup expérimental ?

• Financement : RISC

• Pause café pour 50 : 200 euros x 2 (matin petit déjeuner, et après-midi, pause café). le fournisseur est la potinière.

• Buffet : Le buffet repas coutera au maximum : 890 euros, avec la source voisine.
  • 650 € pour la partie alimentaire
  • 25 € pour les boissons fraiches
  • 40 € pour les cafés
  • 125 e pour les boissons alcoolisées
  • 50 € pour le service.

• Pour la captation vidéo, la cellule webcast de l'IN2P3 : webcaster@cc.in2p3.fr https://webcast.in2p3.fr/ est indisponible, le RISC apportera une caméra qui permettra l'enregistrement mais pas la retransmission.

TODO: privilégier les intervenants locaux pour limiter le budget

* Les Risc, en raison de dépenses non prévues, ne peut pas prendre l'ensemble des missions des intervenant.e.s à sa charge. Rapprochez-vous du Risc risc@risc.cnrs.fr pour trouver une solution.

TODO:

• Rédiger un appel à communications.
• Contacter de possibles intervenants clé.
• Envoyer un appel à communications et retours d'expérience au réseau
• Faire un sondage pour une réunion du bureau fin août début septembre
• Relancer la liste pour appel à proposition ou participation
• Collecter les propositions
• Proposer un planning pour la journée
• Pierre-Emmanuel: Affiner le contenu des présentations demandées à Claude Delpuech et Denis Schwartz, solliciter Emmanuel Maby et Rasa Galbinaite pour des présentations
• Justine : Proposer un logo/image illustrative pour la journée. Contacter chaque intervenant pour demander la finalisation du titre, de l'abstract et lui demander de remplir un formulaire de droit à l'image afin de pouvoir le filmer (ou de savoir qu'on ne filme pas)
• Naïma : Envoyer une relance pour que les participants s'inscrivent à la journée
• Naïma : communiquer la date de la journée aux traiteurs

Le réseau cogiter, qui regroupe chercheurs, ingénieurs et techniciens autour de questions liées à l'ingénierie en sciences cognitives, souhaite organiser une journée thématique sur l'instrumentation en EEG/MEG.

Cette journée aurait lieu en octobre ou en novembre 2018, et pourrait être hébergée à l'institut des sciences cognitives Marc Jeannerod, à Bron, près de Lyon.

Nous sommes à la recherche d'intervenants pour présenter d'une part ces techniques et des façons d'analyser ces signaux, mais aussi pour faire des retours d'expérience sur des domaines d'application particuliers (EEG ultraportable, EEG chez le bébé par exemple), sur des techniques d'analyse ou des développements logiciels que vous souhaiteriez partager.

La plupart des interventions auraient lieu en Français, toutefois il est envisageable de proposer une intervention ciblée en langue anglaise.

Formats :

• présentation orale 45 mn
• présentation orale 40 mn
• présentation courte 5 à 20 mn
• poster

Pour proposer une intervention, merci d'utiliser le formulaire suivant :

https://groupes.renater.fr/limesurvey/index.php?sid=61511&lang=fr

• Pierre-Emmanuel Aguera (CRNL)
• Anne Cheylus (ISC-MJ)
• Pascal Dayre (Devlog, Irit)
• Laurence Delbarre (SCALab, Irdive)
• Justine Epinat-Duclos (ISC-MJ)
• Vincent de Gardelle (RISC)
• Vincent Férotin (RISC)
• Naïma Ghaffari (RISC)
• Marie-Claude Jahan (RISC)

Sciences Cognitives et activité électrique cérébrale (CASC)

9h00-9h30 - Accueil - café
9h30-9h40 - Présentation de la journée par les membres du réseau

Évolution des techniques, usages, plans d'expérience

9h40-11h10 - Denis Schwartz (CRNL, CERMEP) et Claude Delpuech (CRNL, CERMEP) - MEG/EEG : Historique, panorama des techniques d’acquisition et d’analyse du signal, perspectives

11h10-11h25 - Pause - café

Session interactive

11h25-12h00 - Samuel Garcia, Alexandra Corneyllie (CRNL) - pyacq un framework d'acquisition distribué
12h00-12h30 - Emmanuel Maby (CRNL) - Développements technologiques d’un dispositif de Neurofeedback pour la rééducation de l'attention chez les enfants TDA-H

12h30-14h00 - Buffet

Pratiques pour l'acquisition et l'analyse

14h00-14h25 - Ana Flò (unicog, neurospin) - EEG as a tool to study infant’s cognition
14h25-14h45 - Parvaneh Adipbour (ISC-MJ) - Exploring perceptual and cognitive processings through EEG frequency-tagging paradigms
14h45-15h05 - Sylvain Harquel (LPNC,IRMaGe) - Couplage TMS-EEG : technique et applications
15h05-15h20 - Anne-Sophie Dubarry (LPL) - EEG haute-densité : technique et application

Présentation de la société de neuropsychophysiologie 15h20-15h45 - Maximilien Chaumon (Centre MEEG, CENIR, UMR7225) - Simulations de puissance statistique en MEG: Peut-on recommander un nombre d’essais ou de sujets idéal ?

15h45-16h00 - Pause

Retours d'expérience et tables rondes

16h00-16h45 - table ronde animée par Maximilien Chaumon, Lydia Yahia-cherif, Nathalie Georges et Laurent Hugueville Favoriser la reproductibilité des expériences en MEEG: un rôle moteur pour les plateformes MEEG
16h45-17h - Avenir du réseau cogiter
17h-17h15 - Clôture de la journée

MEG/EEG : Historique, panorama des techniques d’acquisition et d’analyse du signal, perspectives

Après un bref historique des techniques MEG et EEG, nous présenterons les systèmes d’acquisition du signal actuels à la disposition des chercheurs avec leurs avantages et inconvénients. Les différentes techniques d’analyses du signal seront abordées : nettoyage du signal, caractérisation temps-fréquence, localisation et analyse de réseaux. Nous terminerons par une revue des développements en cours au niveau matériel et techniques d’analyses. d_schwartz_loc-network-futur-cogiter.pdf

https://vimeo.com/346802095

pyacq un framework d'acquisition distribué

Pyacq est un framework d’acquisition écrit en python. Il permet d’écrire avec de simples scripts des logiciels d’acquisition/visualisation/traitement temps réel sur mesure. Il est écrit avec une architecture distribuée, c’est à dire que l’on peut répartir les traitements/visualisations facilement sur plusieurs machine via des « node » reliés en tcp. Il permet l’acquisition de signaux via différents matériels généralistes (nation instrument, measurement computing, webcam) mais aussi du matériel spécifique EEG (brainvision, emotiv, …) Il intègre aussi des « node » pour l’enregistrement et des visualisations avancées (du simple oscilloscope jusqu’à la carte temps fréquence de Morlet). Une démonstration sera faite dans le contexte d’une manip EEG avec un casque emotiv.

Développements technologiques d’un dispositif de Neurofeedback pour la rééducation de l'attention chez les enfants TDA-H

Les interfaces cerveau-machine sont des neurotechnologies qui ont pour objectif de connecter directement nos neurones à une machine. Parmi leurs applications, le Neurofeedback a pour principe de fournir un retour au patient sur une composante de son activité cérébrale afin qu’il apprenne à la moduler et à la contrôler volontairement. Historiquement, le Trouble de l'Attention avec ou sans Hyperactivité (TDA/H) est une des cibles privilégiées des approches de Neurofeedback. Ces dispositifs demandent une intégration de nombreuses technologies permettant notamment le traitement des signaux EEG en temps réel et l'interaction avec une application dans environnement ludique et engageant.

Cette présentation permettra d'aborder tous ces enjeux et de décrire le dispositif de Neurofeedback que nous avons développé, dans le cadre du projet Mind Your Brain, pour une étude préclinique sur 30 enfants et adolescents souffrant de troubles déficitaires de l'attention.

Puis dans le cadre d'une démonstration, nous proposerons à une personne volontaire d'essayer de contrôler ce dispositif qui l'opposera à une IA dans des jeux interactifs et notamment un jeu inspiré de Puissance 4. e_maby_interface-homme-machine-cogiter.pdf

EEG as a tool to study infant’s cognition

The implementation of EEG in infants’ studies has opened a window to the study of cognition in young infants; nevertheless, many challenges remain open. In this talk, I will discuss the implementation of EEG for the study of infants’ cognitive development. In particular, I will first, present some practical and procedural difficulties in implementing EEG technic in young infants. Second, I will discuss some limitations in the analysis in the context of classical ERP analysis, derive from the fact that in general data is more limited and noisy than in adult studies, and evoke responses and background activity are less well-characterized in infants than in adults. Finally, I will discuss some new protocols, like frequency tagging and neural entrainment procedures. a-flo_infant_s_cognition_cogiter.pdf

Exploring perceptual and cognitive processings through EEG frequency-tagging paradigms

Presenting a stimulus repeatedly at a regular timing, elicits neural responses of the same frequency in the brain, referring to frequency-tagged responses. These responses have high signal-to-noise ratio and can be recorded over relatively short stimulation period, making frequency-tagging pardigms a suitable candidate for research not only in neurotypical populations but also infants and patients. The purpose of the presentation is to describe the core stimulation paradigms that take advantage of this approach to address questions on perceptual and cognitive processings mainly in the domain of vision research in human adults and infants. p_adibpour_frequency-tagging_paradigms-cogiter.pdf https://vimeo.com/344791016

Couplage TMS-EEG : technique et applications

Le couplage entre la stimulation magnétique transcrânienne (TMS) et l’EEG a permis de considérables avancées dans la compréhension des effets de la stimulation corticale en particulier, et dans l'approfondissement des connaissances fondamentales relatives au fonctionnement cérébral de façon plus générale. Cette technique d’imagerie bimodale permet en effet d’observer les modulations de l’activité électrique neuronale induites par la stimulation d’une aire corticale, et ce, de façon précise dans le temps. Ses applications sont multiples, de l’exploration fonctionnelle du cortex à l’étude de nouveaux biomarqueurs pertinents relatifs à certaines pathologies neurologiques et psychiatriques. Dans cet exposé, je présenterai brièvement les principes de base du couplage TMS-EEG, pour insister plus longuement sur ses aspects techniques (montage expérimental, pipelines de traitement du signal, outils disponibles) et ses applications en recherche fondamentale et clinique. s_harquel_tms-eeg-cogiter.pdf https://vimeo.com/344979195

EEG haute-densité : technique et application

High-density electro-encephalography (HD EEG) is used globally in a growing number of sites to measure human brain activity. Compared to standard EEG, HD EEG can offer considerable benefits for a wide range of clinical and research goals.
In this presentation I will focus on the technical aspect of recordings with high-density EEG, and show some of the results that we can obtain using this technique. as_dubarry_eeg_haute-densite-cogiter.pdf https://vimeo.com/344978596

Simulations de puissance statistique en MEG : Peut-on recommander un nombre d’essais ou de sujets idéal ?

La question de savoir combien de sujets et/ou d’essais inclure dans une expérience EEG ou MEG trouve à l’heure actuelle souvent sa réponse dans le savoir faire tacite de chercheurs expérimentés. Un expérimentateur débutant se verra ainsi recommander de faire une trentaine d’essais chez une vingtaine de sujets pour détecter une différence de quelques µV sur une P3… sans autre forme de justification que celle d’un savoir faire ancestral, relevant de la tradition orale, au moins autant qu’écrite. Mais cette recommandation permettrait-elle de détecter un effet à coup sûr ? Quelle taille devrait avoir l’effet en question pour être détecté ? A l’heure où le manque de puissance statistique de certaines études en neurosciences est montré du doigt, une approche plus systématique de cette question semble opportune. C’est dans cette perspective que nous avons simulé des expériences incluant un nombre contrôlé de sujets et d’essais et une source dipolaire d’amplitude, de position et d’orientation définies, plongée dans un bruit physiologique (enregistrements au repos). Conformément à nos attentes, augmenter le nombre de sujets et d’essais augmente la puissance statistique. Nos résultats suggèrent de plus que ce qui définit la détectabilité d’une source n’est pas que sa position et son orientation par rapport aux capteurs, mais aussi la variabilité entre sujets de la région corticale d’où elle provient. Nous illustrons ces effets pour des signaux provenant d’aires cérébrales choisies pour leur pertinence en neurosciences cognitives. n_georges_spnc-cogiter.pdf https://vimeo.com/344979359 chaumon_puce_georges_meg.pdf https://vimeo.com/344978596

Maximilien Chaumon, Lydia Yahia-Cherif, Nathalie Georges et Laurent Hugueville

Dans un contexte de remise en question de la reproductibilité de certaines études scientifiques, de nombreux outils permettant de faciliter les pratiques reproductibles voient le jour. Cette table ronde vise d'une part à présenter l'éventail d'outils disponibles et de sonder le degré de leur utilisation dans la communauté, et d'autre part, de proposer une discussion sur le rôle à jouer pour la communauté des ingénieurs en sciences de la cognition pour la promotion de ces outils. Nous parlerons d'outils tels que:
- Open Science Framework (osf.io) permettant de gérer de nombreux aspects de projets scientifiques (certains diront de A à Z).
- Docker, permettant la gestion de l'environnement logiciel pour un projet
- Git et autres outils de contrôle de versions
- les formats de données standards partageables tels que le BIDS…
La discussion ouverte visera notamment à améliorer le recensement de ces outils, en estimer le niveau d'utilisation dans notre communauté, et éventuellement à proposer des actions pour leur promotion.