Table des matières
Le Calcul à l'INRA : Spécificités et besoins : quelques exemples de programmes scientifiques adossés au calcul
Intervenants :
- Franck Samson (IR MIG, Jouy-en-Josas) pour Migale
- Alain Franc (DR, SFR BIE, Bordeaux-Aquitaine) pour Barcoding
- Hervé Richard pour Record (IE, MIA/BioSP, PACA)
Date : Vendredi 6 septembre 11h45-12h30
Salle : MA2
Objectif
Décrire par des exemples concrets et représentatifs les principaux enjeux “computationels” de questions scientifiques traitées à l'Inra essentiellement dans les domaines de la bioInformatique et la modélisation des eco-agro-systèmes afin de permettre à un ingénieur informaticien hors institut de comprendre les missions de leurs homologues Inra et de percevoir les orientations stratégiques dans le domaine de l'informatique et du calcul.
Plan
3 exposés construits sur un plan similaire :
- Origine du projet : la question scientifique, son enjeu et les verrous techniques identifiés
- la solution déployée
- bilan et perspectives
Contenu
Les sujets sont les suivant :
- Migale, sa panoplie d'outils d'analyse de génome: une PlateForme dédiée à la bioinformatique (Franck Samson)
- Un exemple de calcul pour la biodiversité : Barcoding sur la grille (Alain Franc)
- Record, la PF dédiée à la modélisation des agro-systemes et à l'interopérabilité des modèles (H. Richard)
- Conclusion : ébauches des prochaines orientations de l'institut pour le calcul (Hervé Richard).
