Le Calcul à l'INRA : Spécificités et besoins : quelques exemples de programmes scientifiques adossés au calcul

Intervenants :

  • Franck Samson (IR MIG, Jouy-en-Josas) pour Migale
  • Alain Franc (DR, SFR BIE, Bordeaux-Aquitaine) pour Barcoding
  • Hervé Richard pour Record (IE, MIA/BioSP, PACA)

Date : Vendredi 6 septembre 11h45-12h30

Salle : MA2

Objectif

Décrire par des exemples concrets et représentatifs les principaux enjeux “computationels” de questions scientifiques traitées à l'Inra essentiellement dans les domaines de la bioInformatique et la modélisation des eco-agro-systèmes afin de permettre à un ingénieur informaticien hors institut de comprendre les missions de leurs homologues Inra et de percevoir les orientations stratégiques dans le domaine de l'informatique et du calcul.

Plan

3 exposés construits sur un plan similaire :

  • Origine du projet : la question scientifique, son enjeu et les verrous techniques identifiés
  • la solution déployée
  • bilan et perspectives

Contenu

Les sujets sont les suivant :

  • Migale, sa panoplie d'outils d'analyse de génome: une PlateForme dédiée à la bioinformatique (Franck Samson)
  • Un exemple de calcul pour la biodiversité : Barcoding sur la grille (Alain Franc)
  • Record, la PF dédiée à la modélisation des agro-systemes et à l'interopérabilité des modèles (H. Richard)
  • Conclusion : ébauches des prochaines orientations de l'institut pour le calcul (Hervé Richard).

Présentations

 
jdev2013/t7c4.txt · Dernière modification: 2013/09/09 16:13 par florent.langrognet@univ-fcomte.fr
 
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